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[國外新聞] 英美科學家合作研究利用超性能計算機為病人“抓藥”

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兌水 發表于 2014-4-17 09:46:52 | 只看該作者 回帖獎勵 |倒序瀏覽 |閱讀模式
科學家普遍認識到同種藥物對不同病人的療效存在很大差異,并已開展相關研究,致力于讓計算機為病人選擇個性化治療藥物。
    英國倫敦大學學院和美國羅格斯大學的聯合研究團隊,將基因測序技術和超級計算機技術相結合,試圖探索解決這一命題。研究人員把艾滋病(HIV)蛋白酶分子作為對象,酶在不同人體中形狀略有不同,尤其是在蛋白質活動區,在那里酶完成切片并構成了下一個病毒,進而形成特定的病毒基因序列。如果知道了酶的形狀,就可以找到相應的藥物來阻止這一過程。研究人員通過模擬人體中不同形狀的艾滋病病毒感染的關鍵蛋白質,演示了由計算機優化給出的多種艾滋病治療藥物療效的排序清單。英國倫敦大學學院的皮特.柯文尼教授稱:“有可能通過病人的基因組序列,推斷出酶的形狀,構建準確的蛋白質三維結構,篩選匹配藥物,并將結果告訴主治醫生給出最優處方。”目前,研究團隊已采用這一思路,對市場上在用的9種艾滋病治療藥物中的7種進行了排序驗證。
    科學家表示實際工作遠比看起來復雜。目前他們建立的50多個模擬模型,就要配有5000個處理器的計算機不停的計算12-18個小時,還要對計算結果做大量的數據分析,才能給出藥物的排序。今天的通用計算機技術很難勝任這樣的工作,樂觀的看,依當前計算機技術發展速度看,也許十年后真能實現計算機為病人“抓藥”。
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